Marcadores de adn microsatelite y uso de los mismos

Los microsatélites, marcadores de secuencias repetidas simples (SSR), tienen mucho potencial para incrementar el mapeo del genoma e investigar en laidentificación de genotipos en la genética de los bosques y en los árboles de cultivo. Los marcadoresSSR fueron desarrollados por aislamiento ysecuenciamiento de 1539 clones SSR de pino loblolly para 11 motivos SSR. Después de la búsqueda de redundancia entre las secuencias, fueron sintetizados 566pares de cebadores para PCR de oligonucleótidos queflanquean SSRs, y fueron evaluados en su capacidad para amplificar al ADN genómico del pino loblolly. Lostres motivos SSR que rindieron la mayor proporción de marcadores informativos a partir de los clones secuenciados fueron (AC)n, (AAAT)n, y (AAAC)n. Dieciocholoci SSR polimórficos de tri- y tetra-nucleótidos fueron genotipeados en 20 árboles de pinos loblolly utilizando un análisis automatizado con marcadoresfluorescentes. El promedio observado en el número de alelos por locus fue de 6,4, y elpromedio de contenido de información de polimorfismos (PIC) fue de0,547. De los 566 pares de cebadores se evaluaron, subgrupos según su capacidad para amplificar el ADN a partir de 6 diferentes especies de pinos y 54 pares decebadores que amplificanmarcadores polimórficos entre las especies. La presente también concierne a los métodos para la utilización de los loci SSR comomarcadores genéticos de identificación.